Papanikolaou trafił do Rakowa latem 2020 roku i od sezonu 2021/22 jest podstawowym zawodnikiem linii pomocy "Medalików". W tym sezonie po raz ostatni zagrał 22 października w przegranym 1:2 wyjazdowym meczu z Górnikiem Zabrze. Potem pauzował, ale otrzymał powołanie na listopadowe mecze reprezentacji Grecji. Kłopoty z barkiem sprawiły jednak, że tym razem w drużynie narodowej, w której zadebiutował w czerwcu 2022 roku, nie wystąpi.
Raków przez cztery miesiące bez Papanikolaou. Grek przeszedł operację barku
We wtorek wieczorem Raków Częstochowa oficjalnie poinformował, że piłkarz tego klubu Giannis Papanikolaou przeszedł operację barku. Zabieg przebiegł pomyślnie, a grecki pomocnik powróci do treningów prawdopodobnie po czteromiesięcznej rehabilitacji, czyli w marcu przyszłego roku.