W ćwierćfinałach najbardziej wyrównaną rywalizację stoczyły zespoły One Veszprem i Fuechse Berlin. Na Węgrzech gospodarze wygrali 35:34, a w rewanżu po 60 minutach był wynik 31:30 dla przedstawiciela Bundesligi. Berlińczycy lepiej egzekwowali rzuty karne, cały mecz wygrali 35:33, kwalifikując się do najlepszej czwórki.
Do turnieju nie zdołały awansować zespoły, które w poprzedniej fazie wyeliminowały polskie kluby. Sporting CP, który w barażach pokonał mistrzów Polski, Orlen Wisłę Płock, uległ jedną bramką Aalborgowi. Z kolei Pick Szeged po zwycięskim dwumeczu z Industrią Kielce dwukrotnie wyraźnie przegrał z SC Magdeburg.
Losowanie par półfinałowych Final Four odbędzie się 12 maja.