Były napastnik Samoa, 46-letni Schwalger, był zawieszony od września po tym, jak został oskarżony o niewłaściwe zachowanie seksualne wobec osoby poniżej 16 roku życia.
"Mase dał wszystko naszemu krajowi, a jego wkład w drużynę i naszą społeczność rugby zawsze będzie doceniany" – powiedział w oświadczeniu prezes Lakapi Samoa, Sailele Malielegaoi.
"Jego przywództwo było kluczową częścią naszej podróży" – dodał.
Były front-rower Scarlets i Sale, Schwalger, został mianowany na stanowisku w kwietniu.
"Rezygnacja nastąpiła po okresie zawieszenia przyznanego Mase'owi po złożeniu przeciwko niemu zarzutów karnych w sądzie" - powiedział Lakapi Samoa.
Lakapi Samoa powiedział, że poszukiwania nowego trenera głównego rozpoczną się, gdy sport w kraju jest w chaosie.
Samoa zostało zmuszone do wycofania się z trzech listopadowych turniejów z powodu poważnych problemów finansowych.
Doświadczony podpór Samoa Paul Alo-Emile powiedział AFP w listopadzie, że nie jest pewien, czy będzie nadal grał w drużynie w obliczu problemów poza boiskiem.